ดังที่เราได้เห็นไปแล้ว ความแตกต่างที่ใหญ่ที่สุดระหว่างพระเจ้าในลัทธิเทวนิยมตามธรรมชาติกับพระเจ้าในลัทธิเทวนิยมแบบดั้งเดิมก็คือ พระเจ้าในแบบแรกไม่ได้มีปฏิสัมพันธ์กับโลกที่พระองค์ทรงสร้างขึ้น ผู้ที่นับถือลัทธินี้มักจะกล่าวว่า การที่พระเจ้าจะทรงกระทำเช่นนั้นผ่านทางการแทรกแซงอันน่ามหัศจรรย์ที่เราเรียกว่าปาฏิหาริย์ จำเป็นต้องเป็นการฝ่าฝืนกฎธรรมชาติที่สมบูรณ์แบบซึ่งพระองค์ทรงสร้างขึ้นมา

แต่กฎธรรมชาติไม่ได้เป็นเหมือนกฎจราจรที่ต้องเชื่อฟังหรือฝ่าฝืน ในทางกลับกัน กฎธรรมชาติ (เช่น แรงโน้มถ่วง) เป็นเพียงสิ่งที่อธิบายว่าเหตุการณ์ต่างๆ มักจะเกิดขึ้นอย่างไร เนื่องจากพระเจ้าทรงมีอำนาจเบ็ดเสร็จเหนือความเป็นจริงทั้งหมด พระองค์จึงสามารถแทรกแซงระเบียบธรรมชาติและทำให้สิ่งต่างๆ เกิดขึ้นนอกเหนือไปจากปกติได้ (เช่น การที่มนุษย์เดินบนผิวน้ำที่เป็นของเหลว) สิ่งนี้ไม่ได้เป็นการละเมิดกฎธรรมชาติ เพราะกฎเหล่านี้เป็นเพียงการอธิบายว่าสิ่งที่จะเกิดขึ้นตามปกติในระบบทางกายภาพหนึ่งๆ คืออะไร แต่ไม่ได้เป็นข้อบังคับว่าสิ่งนั้นจะต้องเกิดขึ้นเสมอไปในระบบเหล่านั้น

ตามที่หนังสือคำสอนระบุไว้ว่า พระเจ้าทรงประสงค์ให้เครื่องพิสูจน์ภายนอกแห่งการเปิดเผยของพระองค์ (เช่น ปาฏิหาริย์ของคริสตชนหรือความศักดิ์สิทธิ์ของพระศาสนจักร) ได้มารวมเข้ากับความช่วยเหลือภายในของพระจิต พวกมันคือแรงจูงใจที่น่าเชื่อถือ ซึ่งแสดงให้เห็นว่าการยอมรับด้วยความเชื่อไม่ได้เป็นเพียงแรงผลักดันที่ไร้เหตุผลของจิตใจแต่อย่างใด (CCC 156) กล่าวอีกนัยหนึ่ง พระเจ้าทรงปล่อยให้โลกดำเนินไปตามธรรมชาติของตนเอง แต่ก็ทรงแทรกแซงในบางโอกาส การแทรกแซงเหล่านั้น (เช่น ปาฏิหาริย์) เป็นเหตุผลรองรับความเชื่อที่เรามีต่อพระเจ้าและการเปิดเผยของพระองค์ที่มีต่อเรา

แต่ทำไมเราจึงเชื่อเฉพาะปาฏิหาริย์ของพระเจ้าในศาสนาคริสต์ ทำไมเราจึงไม่เชื่อเรื่องราวปาฏิหาริย์ของศาสนาอื่น เช่น พุทธศาสนาหรือศาสนาอิสลาม เหตุผลประการหนึ่งคือคุณภาพของหลักฐานสำหรับปาฏิหาริย์ของพระคริสต์และของศาสนาอื่นๆ นั้นมีความแตกต่างกัน ตัวอย่างเช่น รายงานที่เก่าแก่ที่สุดเกี่ยวกับการกลับคืนพระชนมชีพของพระเยซูมาจากนักบุญเปาโล อดีตผู้ที่เคยแคลงใจซึ่งรู้จักอัครสาวกกลุ่มแรก ท่านเป็นพยานถึงความเชื่อที่เกิดขึ้นเกือบจะในทันทีของเหล่าอัครสาวกและคริสตชนกลุ่มแรกที่มีต่อการกลับคืนพระชนมชีพของพระเยซู โดยมันไม่ได้เป็นผลผลิตจากตำนานที่แต่งขึ้นในภายหลัง

สิ่งนี้แตกต่างอย่างสิ้นเชิงกับปาฏิหาริย์ที่เกี่ยวข้องกับพระพุทธเจ้าและท่านศาสดามูฮัมหมัด ซึ่งถูกบันทึกไว้หลายร้อยปีหลังจากที่พวกท่านสิ้นชีวิตไปแล้ว ปาฏิหาริย์เหล่านั้นดูเหมือนจะเป็นชั้นตำนานที่ถูกเติมแต่งเข้ามาในชีวิตของบรรดาผู้ประกาศคำสอนที่มีความสามารถโน้มน้าวใจแต่ก็เป็นเพียงมนุษย์ปุถุชน ซึ่งทั้งสองท่านปฏิเสธที่จะทำการอัศจรรย์ในช่วงชีวิตของตนเอง ตรงกันข้ามกับพระเยซูผู้ซึ่งปาฏิหาริย์เป็นส่วนสำคัญในพันธกิจของพระองค์

การกลับคืนพระชนมชีพจากความตายของพระคริสต์เป็นการพิสูจน์คำกล่าวอ้างเกี่ยวกับพระเทวภาพของพระองค์ และคำอธิบายทางธรรมชาติทั้งหมดสำหรับเรื่องราวการกลับคืนพระชนมชีพก็ไม่สามารถอธิบายหลักฐานเหล่านี้ได้อย่างสมเหตุสมผล ตัวอย่างเช่น การอ้างว่าเรื่องราวเหล่านี้เป็นเพียงตำนานนั้นใช้ไม่ได้ผล เนื่องจากเรามีจดหมายของนักบุญเปาโล และท่านก็รู้จักเป็นการส่วนตัวกับเปโตรและอัครสาวกคนอื่นๆ ซึ่งเป็นประจักษ์พยานและได้ประกาศเรื่องการกลับคืนพระชนมชีพ (กท. 1:18–19, 1 คร. 15:3–7) ดังนั้นจึงต้องมีคำอธิบายว่าทำไมพวกเขาจึงประกาศว่ารับบีผู้ล่วงลับของตนได้ฟื้นคืนชีวิตขึ้นมา

การอ้างว่าพวกเขาโกหกเพื่อแลกกับผลประโยชน์ทางวัตถุหรือชื่อเสียงนั้นก็ไม่เพียงพอ เพราะอัครสาวกเหล่านั้นถูกเบียดเบียนและต้องพลีชีพเพื่อความเชื่อของตน และไม่มีใครเคยกลับคำให้การของตนเลย การบอกว่าอัครสาวกเห็นภาพหลอนเกี่ยวกับการกลับคืนพระชนมชีพก็ใช้ไม่ได้ผลเช่นกัน เนื่องจากพวกเขาเห็นพระเยซูรวมกันเป็นกลุ่มในบางโอกาส (1 คร. 15:5–7) และโดยเกือบจะทั้งหมดแล้วผู้ที่ประสบกับอาการเห็นภาพหลอนมักจะเป็นบุคคลเดียว ไม่ใช่การเห็นเป็นกลุ่ม

ปัญหาอีกประการหนึ่งของทฤษฎีนี้คือ การกลับคืนพระชนมชีพทางร่างกายจากความตายไม่ใช่สิ่งที่อัครสาวกน่าจะจินตนาการขึ้นมาได้ เอ็น. ที. ไรท์ นักประวัติศาสตร์ในหนังสือของเขาชื่อ The Resurrection of the Son of God ได้ค้นคว้าวรรณกรรมโบราณและไม่พบตัวอย่างใดเลยในโลกนอกศาสนาหรือในความคิดของชาวยิวเกี่ยวกับความเชื่อที่ว่าบุคคลหนึ่งตายไปแล้ว ได้สัมผัสชีวิตหลังความตาย และกลับมาสู่การดำรงอยู่ทางร่างกายที่เป็นอมตะและได้รับสิริรุ่งโรจน์ในชีวิตปัจจุบัน หากอัครสาวกทุกคนเกิดอาการเห็นภาพหลอนหรือฉายภาพบางอย่างที่น่าจะเป็นไปได้และคุ้นเคยสำหรับพวกเขา พวกเขาก็น่าจะจินตนาการถึงสิ่งที่สอดคล้องกับความเชื่อที่มีอยู่เดิม เช่น พระคริสต์ผู้ทรงถูกรับขึ้นสวรรค์ไปในฝ่ายจิต แต่อัครสาวกไม่ได้ประกาศเช่นนั้นเลย พวกเขากลับประกาศอย่างหนักแน่นว่าพระเยซูทรงกลับคืนพระชนมชีพขึ้นมาจากความตายทางร่างกาย

ต่อให้พวกอัครสาวกจะมีแรงจูงใจให้เชื่อในพระเยซูโดยปราศจากการกลับคืนพระชนมชีพ แต่ก็ไม่มีแรงจูงใจเช่นนั้นเลยสำหรับศัตรูของพระเยซู ซาอูลแห่งทาร์ซัส (ต่อมาคือนักบุญเปาโลอัครสาวก) เป็นชาวฟาริสีที่เคยเบียดเบียนคริสตจักรยุคแรก และยากอบซึ่งน่าจะเป็นญาติคนหนึ่งของพระเยซูก็อาจเคยปฏิเสธพระองค์ในตอนแรก แต่หลังจากที่ได้เผชิญหน้ากับพระคริสต์ผู้ทรงกลับคืนพระชนมชีพ ซาอูลก็ได้เปลี่ยนความเชื่อของตนอย่างสิ้นเชิงและเข้าร่วมกับกลุ่มชาวยิวที่เขาเคยมองว่าเป็นพวกนอกรีตและเคยเบียดเบียน ส่วนยากอบก็ยอมพลีชีพเพื่อความเชื่อของตนในพระคริสต์ จะมีอะไรอื่นอีกเล่าที่จะอธิบายการกลับใจเลื่อมใสอย่างฉับพลันและน่าประหลาดใจของพวกเขาได้ นอกจากการได้เผชิญหน้ากับพระคริสต์ผู้ทรงกลับคืนพระชนมชีพอย่างแท้จริง